تم بناء نظام أتمتة متكامل في النقابة يجمع كافة مباني النقابة مع بعضها بحيث يدير حسابات الصيادلة والصيدليات، وحركة الفواتير الدوائية ضمن النقابة، كما تم ربط النظام بموقع إنترنت متميز يتيح مجموعة من الخدمات المتميزة للصيادلة ويربطهم بنقابتهم، كما يساعد المواطن في إيجاد أقرب صيدلية إلى مكان تواجده من خلال خريطة إلكترونية متطورة مرتبطة بالخدمة الشهيرة Google map.